药物设计学
简述CoMFA操作基本过程。
题目
简述CoMFA操作基本过程。
参考答案和解析
正确答案:
1、构建分子，进行结构优化确定活性构象（药效构象）。
2、计算分子中的原子的形式电荷。获取原子净电荷以便能计算分子的静电力场。
3、选择合适的叠加规则叠加分子，这是CoMFA的关键步骤。
4、在分子周围空间中打上三维网格点，使用一个探针原子计算每个格点对应于每个分子的能量值，得出分子场。
5、用PLS建立分子场与生物活性之间的关系，并用交叉验证来检验PLS得到的模型的可靠性。
6、用三维等高线图形显示QSAR模型，显示立体与静电的有利与不利区域，根据此图设计新的化合物，并预测其活性。
2、计算分子中的原子的形式电荷。获取原子净电荷以便能计算分子的静电力场。
3、选择合适的叠加规则叠加分子，这是CoMFA的关键步骤。
4、在分子周围空间中打上三维网格点，使用一个探针原子计算每个格点对应于每个分子的能量值，得出分子场。
5、用PLS建立分子场与生物活性之间的关系，并用交叉验证来检验PLS得到的模型的可靠性。
6、用三维等高线图形显示QSAR模型，显示立体与静电的有利与不利区域，根据此图设计新的化合物，并预测其活性。
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